GBE 340 | Ders Tanıtım Bilgileri - Biyomedikal Mühendisliği

Dersin Adı

Hücre Ölüm Mekanizmaları

Kodu	Yarıyıl	Teori (saat/hafta)	Uygulama/Lab (saat/hafta)	Yerel Kredi	AKTS
GBE 340	Güz/Bahar	3	0	3	5

Ön-Koşul(lar)	Yok
Dersin Dili	İngilizce
Dersin Türü	Seçmeli
Dersin Düzeyi	Lisans
Dersin Veriliş Şekli	-
Dersin Öğretim Yöntem ve Teknikleri	Tartışma Grup çalışması Soru & Cevap Anlatım / Sunum
Ulusal Meslek Sınıflandırma Kodu	-
Dersin Koordinatörü	Prof. Dr. Zeynep Fırtına Karagonlar
Öğretim Eleman(lar)ı	Dr. Öğr. Üyesi Gizem AYNA DURAN
Yardımcı(ları)	-

Dersin Amacı

Bu dersin amacı, öğrencilere hücre ölüm mekanizmalarının temel prensiplerini anlatmak ve bu mekanizmaların gelişim, fizyoloji ve patolojideki rollerini tanıtmaktır. Dersin içeriği, hücre ölüm mekanizmaları alanında apoptoz, otofaji, nekroz, nekroptoz, lizozom-aracılı hücre ölümü, entoz, anoikis, ferroptoz, piroptoz, anastaz, mitotik ölüm ve immunojenik hücre ölümü gibi çok çeşitli konuları kapsamaktadır.

Öğrenme Çıktıları

#	İçerik	PÇ Sub	* Katkı Düzeyi
#	İçerik	PÇ Sub	1	2	3	4	5
1	Hücre ölüm mekanizmalarının temel prensiplerini açıklayabilecek
2	Hücre ölüm mekanizmalarını analiz etmede kullanılan yöntemleri uygulayabilecek
3	Bu alandaki bilimsel çalışmaları tasarım, hipotez, ve değer yönünden değerlendirebilecek ve belirli bir konu hakkında literatür araştırması yapıp o konu hakkında yazılı ve sözlü şekilde bilgilerini paylaşabilecek
4	Farklı hücre ölüm mekanizmaları arasındaki karşılıklı etkilşimleri açıklayabilecek
5	Hücre ölüm mekanizmalarındaki düzensizliklerin kanser ve nörodejeneratif hastalıklar gibi patolojik durumların oluşumuna nasıl yol açabileceğini tamınlayabilecek

Ders Tanımı

Bu ders hücre ölümünün moleküler mekanizmaları, apoptoz, otofaji, nekroz, nekroptoz, lizozom-aracılı hücre ölümü, entoz, anoikis, ferroptoz, piroptoz, anastaz, mitotik ölüm ve immunojenik hücre ölümü konularının açıklanmasını kapsar.

Dersin İlişkili Olduğu Sürdürülebilir Kalkınma Amaçları

Dersin Kategorisi	Temel Ders
	Uzmanlık/Alan Dersleri
	Destek Dersleri
	İletişim ve Yönetim Becerileri Dersleri
	Aktarılabilir Beceri Dersleri

Hafta	Konular	Ön Hazırlık	Öğrenme Çıktısı
1	Hücre ölümü modalitelerine giriş	Alberts et.al. 6th Edition. Chapter 18.
2	Programlanmamış gücre ölümü: Nekroz	Alberts et.al. 6th Edition. Chapter 18.
3	Programlanmış apoptotik hücre ölümü: Apoptotik hücre ölümü ve Anoikis	Galluzzi, Lorenzo et al. “Molecular mechanisms of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2018” Cell death and differentiation vol. 25,3 (2018): 486-541.
4	İç ve Dış Apoptotik Hücre Ölümü	Galluzzi, Lorenzo et al. “Molecular mechanisms of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2018” Cell death and differentiation vol. 25,3 (2018): 486-541.
5	Apoptotik hücre ölümü tespit yöntemleri	Hugh J. M. Brady. Apoptosis Methods and Protocols. Humana Press 2004. https://doi.org/10.1385/1592598129
6	Programlanmış apoptotik olmayan hücre ölümü: Vakuol tabanlı	Galluzzi, L et al. “Molecular definitions of cell death subroutines: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2012” Cell death and differentiation vol. 19,1 (2011): 107-20.
7	Programlanmış apoptotik olmayan hücre ölümü: Mitokondri ve demir tabanlı	Kroemer, G et al. “Classification of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2009” Cell death and differentiation vol. 16,1 (2008): 3-11.
8	Ara sınav	Kroemer, G et al. “Classification of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2009” Cell death and differentiation vol. 16,1 (2008): 3-11.
9	Programlanmış apoptotik olmayan hücre ölümü: Vakuol bazlı - İmmünojenik hücre ölümü ve diğerleri	Galluzzi, Lorenzo et al. “Molecular mechanisms of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2018” Cell death and differentiation vol. 25,3 (2018): 486-541.
10	Prokaryotlarda programlanmış hücre ölümü	Galluzzi, Lorenzo et al. “Molecular mechanisms of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2018” Cell death and differentiation vol. 25,3 (2018): 486-541.
11	Hücre ölümünün klinik yönleri	Douglas R Green. Means to an End: Apoptosis and Other Cell Death Mechanisms. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2017. Galluzzi, Lorenzo et al. “Molecular mechanisms of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2018” Cell death and differentiation vol. 25,3 (2018): 486-541.
12	Anastaz, mitotik yıkım ve hücresel yaşlanma gibi ölümcül olmayan süreçler	Hochman A. Programmed cell death in prokaryotes. Crit Rev Microbiol. 1997;23(3):207-14.
13	Hücre-içinde-hücre ölümü (entoz, kanibalizm ve emperitoz)	Galluzzi L, Buqué A, Kepp O, Zitvogel L, Kroemer G. Immunogenic cell death in cancer and infectious disease. Nat Rev Immunol. 2017 Feb;17(2):97-111. doi: 10.1038/nri.2016.107. Epub 2016 Oct 17.
14	Dönem tekrarı
15	Dönem tekrarı
16	Final sınavı

Ders Kitabı

Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, David Morgan, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter. Molecular Biology of the Cell. Sixth Edition. Chapter 18 – Cell Death. Garland Science, 2014: New York and Abingdon, UK.

Douglas R Green. Means to an End: Apoptosis and Other Cell Death Mechanisms. Cold Spring Harbor Laboratory Press. 2017.

Önerilen Okumalar/Materyaller

Galluzzi, Lorenzo et al. “Molecular mechanisms of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2018” Cell death and differentiation vol. 25,3 (2018): 486-541.

Galluzzi, L et al. “Molecular definitions of cell death subroutines: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2012” Cell death and differentiation vol. 19,1 (2011): 107-20.

Kroemer, G et al. “Classification of cell death: recommendations of the Nomenclature Committee on Cell Death 2009” Cell death and differentiation vol. 16,1 (2008): 3-11.

Sun G and Montell DJ. Q&A: Cellular near death experiences-what is anastasis? BMC Biol. 2017 Oct 24;15(1):92. doi: 10.1186/s12915-017-0441-z.

Yarıyıl Aktiviteleri	Sayı	Katkı Payı %	LO 1	LO 2	LO 3	LO 4	LO 5
Katılım
Laboratuvar / Uygulama
Arazi Çalışması
Küçük Sınav / Stüdyo Kritiği
Portfolyo
Ödev	1	15
Sunum / Jüri Önünde Sunum	1	15
Proje
Seminer/Çalıştay
Sözlü Sınav
Ara Sınav	1	30
Final Sınavı	1	40
Toplam

Yarıyıl İçi Çalışmalarının Başarı Notuna Katkısı	3	70
Yarıyıl Sonu Çalışmalarının Başarı Notuna Katkısı	1	30
Toplam

Yarıyıl Aktiviteleri	Sayı	Süre (Saat)	İş Yükü
Teorik Ders Saati (Sınav haftası dahildir: 16 x teorik ders saati)	16	3	48
Laboratuvar / Uygulama Ders Saati (Sınav haftası dahildir. 16 x uygulama/lab ders saati)	16		0
Sınıf Dışı Ders Çalışması	16	2	32
Arazi Çalışması			0
Küçük Sınav / Stüdyo Kritiği			0
Portfolyo			0
Ödev	1	10	10
Sunum / Jüri Önünde Sunum	1	20	20
Proje			0
Seminer/Çalıştay			0
Sözlü Sınav			0
Ara Sınavlar	1	20	20
Final Sınavı	1	20	20
		Toplam	150

#	PÇ Sub	Program Yeterlilikleri / Çıktıları	* Katkı Düzeyi
#	PÇ Sub	Program Yeterlilikleri / Çıktıları	1	2	3	4	5
1	Matematik, Fen Bilimleri ve Biyomedikal Mühendisliği konularında yeterli bilgi sahibidir; bu alanlardaki kuramsal ve uygulamalı bilgileri, karmaşık mühendislik problemlerinde kullanır.		-	-	-	-	-
2	Karmaşık Biyomedikal Mühendisliği problemlerini saptar, tanımlar, formüle eder ve çözer; bu amaca uygun analiz ve modelleme yöntemlerini seçer ve uygular.		-	-	-	-	-
3	Karmaşık bir sistemi, süreci, cihazı veya ürünü gerçekçi kısıtlar ve koşullar altında, belirli gereksinimleri karşılayacak şekilde tasarlar; bu amaçla modern tasarım yöntemlerini uygular.		-	-	-	-	-
4	Biyomedikal Mühendisliği uygulamalarında karşılaşılan karmaşık problemlerin analizi ve çözümü için gerekli olan modern teknik ve araçları geliştirir, seçer ve kullanır.		-	-	-	-	-
5	Karmaşık Biyomedikal Mühendisliği problemlerinin veya araştırma konularının incelenmesi için deney tasarlar, deney yapar, veri toplar, sonuçları analiz eder ve yorumlar.		-	-	-	-	-
6	Biyomedikal Mühendisliği disiplini içinde ve çok disiplinli takımlarda etkin biçimde çalışır; bireysel çalışma sergiler.		-	-	-	-	-
7	Türkçe sözlü ve yazılı etkin iletişim kurar; etkin rapor yazar ve yazılı raporları anlar, tasarım ve üretim raporları hazırlar, etkin sunum yapar, açık ve anlaşılır talimat verir ve alır.		-	-	-	-	-
8	Biyomedikal Mühendisliği uygulamalarının evrensel ve toplumsal boyutlarda sağlık, çevre ve güvenlik üzerindeki etkileri ve çağın mühendislik alanına yansıyan sorunları hakkında bilgi sahibidir; mühendislik çözümlerinin hukuksal sonuçlarının farkındadır.		-	-	-	-	-
9	Etik ilkelerine uygun davranma, mesleki ve etik sorumluluk bilincine sahiptir; mühendislik uygulamalarında kullanılan standartlar hakkında bilgi sahibidir.		-	-	-	-	-
10	Proje yönetimi, risk yönetimi ve değişiklik yönetimi gibi, iş hayatındaki uygulamalar hakkında bilgi sahibidir; girişimcilik, yenilikçilik hakkında bilinçlidir; sürdürülebilir kalkınma hakkında bilgi sahibidir.		-	-	-	-	-
11	Bir yabancı dili kullanarak Biyomedikal Mühendisliği ile ilişkili konularda, bilgi toplar ve meslektaşları ile iletişim kurar.		-	-	-	-	-
12	İkinci yabancı dili orta düzeyde kullanır.		-	-	-	-	-
13	Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilincindedir; bilgiye erişir, bilim ve teknolojideki gelişmeleri izler ve kendini sürekli yeniler; insanlık tarihi boyunca oluşan bilgi birikimini Biyomedikal Mühendisliği alanıyla ilişkilendirir.		-	-	-	-	-

GBE 340 | Ders Tanıtım Bilgileri

HAFTALIK KONULAR VE İLGİLİ ÖN HAZIRLIK ÇALIŞMALARI

DEĞERLENDİRME ÖLÇÜTLERİ

AKTS / İŞ YÜKÜ TABLOSU

DERSİN ÖĞRENME ÇIKTILARININ PROGRAM YETERLİLİKLERİ İLE İLİŞKİSİ

Sosyal Medya

Sosyal Medya

HABERTÜM HABERLER

3 haftalık Biyoinformatik Kampı başarı ile tamamlanmıştır

Bitkisel Güzellik: Mor Lahanadan Ruj ve Allık

Öğrencilerimiz ile THI Medikal Firmasına Teknik Gezi

Dermoskopik Görüntülerden Melanom Tespiti çalışması ödül aldı

İspanya Universidad Jaume Üniversitesi ile Biyomedikal Mühendisliği Erasmus Anlaşması Yapıldı

İzmir Ekonomi Üniversitesi Medical Point Hastanesi Klinik Mühendisi Semineri

İş Sağlığı ve Güvenliği Semineri

An Oligonucleotide Story by Assoc. Prof. Dr. Osman DOLUCA

YENİ GÜZELBAHÇE KAMPÜSÜMÜZ

KÜRESEL KARİYER

BİLİME KATKI

İNSANA DEĞER

TOPLUMA FAYDA